Pro konečné testování a specifická řešení Meopta vyvíjí vlastní softwarové aplikace, které přesně vyhovují příslušnému účelu (SW aplikace pro měření MTF, SW pro WFE měření senzorem Meopta Shack-Hartmann, řízení pohybu motoru, atd ).
Meopta se v této oblasti dynamicky rozvíjí a stává se objektem zájmu pro spolupráci s vysokými školami, a v programech podporovaných vládou. Meopta se zaměřuje na studenty vysokých škol a pracuje s nimi na zdokonalení jejich schopností, které pomáhají dosáhnout cílů projektů.
Jedním z aktuálně probíhajících projektů je vývoj senzoru detekce vlnoplochy Shack-Hartmann realizovaný ve spolupráci s katedrou optiky Univerzity Palackého v Olomouci. Cíle projektu jsou akvizice algoritmických struktur, realizace SW aplikace a technická realizace senzoru v několika modifikacích, které se liší rozlišením a dynamickým rozsahem.